Laboratoire de Physique et Chimie des Nano-objets

Institut National des Sciences Appliquées
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Peptidomimétique

La recherche d’alternatives non peptidiques pour remédier aux effets des protéases sur diverses substances médicamenteuses a donné lieu à la peptidomimétique - art de concevoir des variations structurales sur les enchaînements d’aminoacides. En 2005, nous avons proposé que contrairement aux idées reçues – basées sur la notion de conflit stérique – des polypeptides tout-cis pourraient présenter une certaine stabilité (cf figure ci-dessus). Nous nous sommes engagés sur d’autres voies, en collaboration avec une équipe de biochimie expérimentale : l’étude de peptidomimétiques à base de fonctions urée. La fonction urée, par sa capacité à former des liaisons hydrogènes auto-complémentaires bidirectionnelles, peut être utilisée en remplacement du lien amide pour générer des brins oligomériques linéaires (foldamères) s’organisant à l’échelle moléculaire pour former des motifs structuraux mimant les structures secondaires des protéines (coudes, hélices, ...). Il est également possible d’exploiter les propriétés donneur-accepteur de la liaison hydrogène du lien urée pour générer des systèmes peptidomimétiques capables d’organisation supramoléculaire. Nous nous sommes en outre engagés sur la proposition de nouveaux foldamères basés sur des motifs structuraux dont la synthèse expérimentale est bien maîtrisée. Il s’agit là de faire des propositions originales (basées sur des calculs de chimie théorique de type ab initio), pouvant susciter des travaux expérimentaux de nos partenaires.

Collaborations :
G.Trinquier, S. Mathieu, Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques, (Toulouse, France)
G. Guichard, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, (Strasbourg, France)
Publications :
R. Poteau, G. Trinquier, "All-cis cyclic peptides." Journal of the American Chemical Society, 127 :13875–13889, 2005
R. Poteau, G. Trinquier, "All-cis helical polypeptides." Journal of Organic Chemistry, 72 :8251–8258, 2007
L.Fischer, C.Didierjean, F.Jolibois, V.Semetey, J.M.Lozano, J-P. Briand, M.Marraud, R.Poteau, G.Guichard, "Propensity for local folding induced by the urea fragment in short chain oligomers.", Org.Biomol.Chem. 14, 2596-261, 2008